一、前置说明

oCelloScope配套UniExplorer软件采集的数据包含两类核心素材:时序BCA生物量(等效时序OD生长数据)、逐帧显微图像。很多使用者分开导出、手动整理表格,效率低且容易出现时间戳错位。本流程规范UniExplorer数据导出规范,实现结构化表格直接导入Origin,同时配套图像与曲线组合排版方案,适配微生物生长动力学SCI绘图。


二、第一步:UniExplorer软件规范导出时序数值数据

1. 在UniExplorer打开完成监测的实验工程,筛选目标微孔通道,剔除空白、污染无效孔。

2. 数据输出选择【Export data】,导出格式选定CSV(逗号分隔),不要选用TXT自定义格式。

3. 导出参数勾选:时间(h)、BCA生物量数值;可同步导出形态参数(细胞面积、分支长度等)。

4. 关键设置:关闭多余注释表头,仅保留一行字段标题;时间单位统一设置为小时,避免分钟、小时混用造成坐标轴混乱。

5. 保存文件路径不要使用中文、空格,防止Origin导入识别异常。


三、第二步:UniExplorer时序显微图像批量导出

1. 在图像预览窗口,设置时间节点,按需导出关键时间点图像(延滞期、对数期、裂解特征时刻)。

2. 导出格式选择PNG/TIFF,分辨率设置300 dpi;统一图像标尺,标尺信息嵌入图片。

3. 批量导出命名规范:样品编号_时间点,方便Origin图版拼接。

4. 论文原始影像素材建议完整保存工程文件,审稿人溯源可调取原始时序视频。


四、第三步:CSV文件一键导入Origin操作流程

1. 打开Origin,新建空白Workbook工作表。

2. 方式一(推荐一键导入):File → Import → Import Wizard,选中导出的CSV文件;分隔符选择【逗号】,预览窗口核对时间、BCA数值正常。

3. 方式二:直接将CSV文件拖拽至Origin空白界面,软件自动识别字段。

4. 列属性设置:时间列设为X,BCA生物量设为Y;多组样品依次导入,每组独立Y列,方便多曲线叠加绘图。

5. 数据清洗:剔除设备短暂波动产生的异常离群点;记录数据剔除标准,论文方法部分可注明。


五、第四步:Origin绘图与图像组合排版(SCI标准)

1. 选中X(时间)、各组Y(BCA生物量),绘制折线生长曲线;对照组、实验组配色统一,低饱和色系。

2. 进阶优化:采用均值曲线+半透明误差阴影,多生物学重复数据标准化展示。

3. 时序图像嵌入图版:Graph窗口右键【New Layer】,插入导出的显微图片,实现“生长动力学曲线+对应时刻显微图像”复合图版,是微生物领域高分论文常用版式。

4. 坐标轴规范:X轴为培养时间(h),Y轴标注BCA生物量;字体统一Arial,导出图片300 dpi TIFF格式。


六、常见故障与避坑要点

1. 导入后全部数据在单列:导出CSV时分隔符错误,重新导出,确认使用英文逗号分隔。

2. 时间戳乱序:UniExplorer导出前不要手动打乱采样序列,导入后按照时间升序排序。

3. 图像粘贴失真:不要截图保存图像,直接从UniExplorer导出高分辨率原图再嵌入Origin。

4. 多微孔数据混淆:导出前做好分组命名,导入Origin后对每一列添加样品名称Long Name,防止图例标注错误。


七、论文方法段落可直接复用

中文:利用oCelloScope时序成像系统开展微生物动态监测,原始数据通过UniExplorer软件导出时序BCA生物量数据与显微图像。CSV格式数值文件导入Origin软件进行数据整理、生长曲线绘制;关键时间节点显微图像批量导出,在Origin内完成动力学曲线与显微图像的组合图版排版,用于表征微生物生长动态与微观形态变化。

英文:Time-lapse monitoring was performed using the oCelloScope system. Temporal BCA biomass data and microscopic snapshots were exported via UniExplorer. CSV-formatted quantitative data were imported into Origin for data sorting and growth curve plotting. Representative images at characteristic time points were embedded into graph layouts to combine kinetic profiles and morphological observations.