λ（延滞期时长）、μ（最大比生长速率）、AUC（生长曲线下面积）是微生物生长动力学核心指标；细胞面积、长宽比、分支密度等形态参数为微观表型关键数据。UniExplorer无需第三方软件预处理，可基于时序成像数据批量运算，一次性输出所有微孔样品动力学参数与形态定量结果，避免单点手动计算带来人为误差，适配高通量96孔板实验数据，满足SCI论文批量统计需求。

二、前置准备工作

1. 打开完整监测工程文件，检查所有时序图像与BCA生物量时序数据完整无缺失，剔除污染、蒸发异常、成像失效的无效微孔。

2. 统一基线校正：选取空白孔数据进行基线扣除，消除培养基杂质、结晶带来的背景信号干扰。

3. 参数配置提前锁定：拟合模型优先选用Baranyi模型（微生物领域通用），在软件设置内选定模型，统一所有样品拟合条件，杜绝自适应参数造成对比不公平。

三、批量计算生长动力学参数（λ、μ、AUC）操作步骤

1. 在软件主界面选中全部需要分析的微孔曲线，支持框选整组对照组、各处理组批量勾选。

2. 打开数据分析模块【Growth Analysis】，启用动力学拟合功能。

3. 设置拟合边界：自定义时间区间，根据实验周期限定拟合范围，排除后期蒸发、细胞裂解造成的曲线异常下降段。

4. 勾选目标输出参数：Lag phase（λ，延滞期）、Maximum specific growth rate（μ，最大比生长速率）、Area under curve（AUC）、最大生物量、平台期时长。

5. 启动批量拟合运算，软件自动对每条时序曲线独立拟合，生成拟合优度R²，便于筛选拟合质量合格的数据。

6. 运算完成后，选择【Export Result Table】导出CSV表格，每条微孔数据单独一行，参数分列输出，可直接导入Origin、SPSS开展显著性分析。

四、批量提取细胞/菌丝形态参数操作步骤

1. 切换至【Particle & Morphology Analysis】粒子形态分析模块，启用单细胞/微菌落分割算法。

2. 设置形态识别阈值：调整颗粒尺寸筛选范围，过滤气泡、晶体、碎屑等微小杂质；混合菌群体系可加载形态分类模板区分不同菌种。

3. 勾选批量输出指标：平均细胞面积、长宽比、圆度、分支总长度、分支密度、粒子数量、平均直径。

4. 选择数据输出模式：可输出**每个时间点平均形态参数**，实现形态时序动态变化追踪。

5. 同步导出形态参数表格，与动力学参数表格通过微孔编号进行匹配关联。

五、数据质控筛选标准（SCI论文必备）

1. 保留拟合优度R²达到阈值（一般R²>0.90）的数据，拟合效果较差的曲线进行标记，酌情剔除并在论文方法中说明筛选标准。

2. 核对异常参数：λ数值异常偏大、μ出现负值，大多是曲线基线漂移、早期污染导致，需要溯源原始时序图像确认样品状态。

3. 动力学参数与显微图像互相印证：延滞期时长应当和图像内首次观测到细胞增殖时间保持一致。

六、论文方法段落可直接复制

中文：实验时序监测数据采用UniExplorer软件进行批量分析。基于Baranyi生长模型自动拟合生长曲线，批量计算延滞期λ、最大比生长速率μ、生长曲线AUC面积等动力学参数。同时启用形态学分析模块，批量提取细胞形态定量指标。所有参数结果导出为CSV格式，用于后续统计学分析与绘图。

英文：Time-series data were processed in batch using UniExplorer software. Growth curves were fitted automatically based on the Baranyi model to calculate kinetic parameters including lag phase (λ), maximum specific growth rate (μ) and area under the curve (AUC). Morphological analysis module was activated to extract cellular quantitative indicators in batches. All calculated parameters were exported as CSV files for subsequent statistical analysis and plotting.

七、常见问题规避

1. 批量拟合参数差异过大：确认所有样品使用完全一致拟合模型与时间区间，禁止分批次修改拟合条件；

2. 形态参数波动剧烈：优化颗粒识别阈值，利用空白对照剔除基质杂质信号；

3. AUC计算分歧：软件默认采用梯形法积分，论文方法部分写明AUC积分计算方式，方便审稿人复核。