一、功能概述

oCelloScope高通量成像采集96孔板时序图像,通过UniExplorer软件输出TA/BCA吸收时序曲线,单次实验可生成几十至上百条微生物生长、裂解、菌丝延伸动力学曲线。逐一点击手动拟合效率极低,软件内置批量拟合模块,支持对整板、指定孔组一键统一模型拟合,批量输出延滞期λ、最大比生长速率μmax、最大生物量A、裂解速率等关键动力学参数,适配噬菌体实验、抑菌筛选、菌群高通量筛选等大批量样本课题,满足SCI高通量数据标准化处理要求。


二、标准化批量拟合完整操作步骤

1.实验数据预处理

完成成像采集,在UniExplorer内加载实验工程;使用图像预览功能批量剔除孔内气泡、污染、边缘异常视野,标记无效曲线,避免异常数据干扰批量拟合收敛。统一选择计算算法,固定采用TA或者BCA背景校正吸收算法,全程算法保持一致。

2.分组定义与筛选

使用孔板分组工具,对空白对照组、不同浓度处理组、重复样本进行分组标记;支持勾选全部有效孔、框选局部区域,实现指定批次曲线批量拟合,无需全板强制运算。

3.批量拟合模型参数统一配置

打开动力学批量拟合窗口,选定目标模型:Logistic、Gompertz、Baranyi模型三选一,整篇论文全程固定模型;统一设置拟合初始参数范围、迭代次数、收敛阈值、残差判定标准;禁止不同组别使用差异化初始参数,保证数据横向可比。

4.启动一键批量拟合

参数保存为模板,点击批量运算;软件自动逐条曲线非线性拟合,自动记录每条曲线R²、残差;拟合失败的曲线自动标记,方便后续单独复核与剔除。

5.批量结果导出与质控筛选

拟合完成后,一键导出CSV汇总表格,包含孔位编号、组别、所有动力学参数、拟合优度R²。根据R²阈值筛选有效拟合结果,通常保留R²>0.90的数据,剔除噪声过大、形态异常曲线。


三、批量拟合核心质控要点(论文可信度关键)

1.统一拟合边界条件,所有曲线使用完全一致的模型、初始值、时间区间,禁止人为调整单条曲线参数,避免主观偏差,应对审稿人数据处理质疑。

2.区分拟合失败常见诱因:起始基线漂移、长时间蒸发、菌体沉降、气泡干扰,优先回到原始图像核查,不随意手动修改拟合结果。

3.批量拟合完成后随机抽取10%曲线,核对拟合曲线与原始时序曲线重合度,建立复核记录,可作为论文补充材料。

4.若大量曲线拟合不收敛,可适当裁剪时序起点,去除成像初期不稳定基线区间,再重新批量运算。


四、论文材料方法可直接复用中文段落

采用oCelloScope高通量动态成像系统采集时序图像,通过配套UniExplorer软件计算校正吸收值,构建微生物生长动力学曲线。选取统一动力学模型,设置固定拟合初始条件与收敛参数,对全部有效样本曲线执行批量自动拟合,批量提取延滞期、最大比生长速率、最大生物量等动力学参数。基于拟合决定系数筛选有效数据,剔除拟合效果较差的曲线,完成高通量动力学定量分析。


五、SCI英文标准段落

Time-lapse images were captured using the oCelloScope imaging system. Corrected absorbance values were calculated in UniExplorer software to construct kinetic curves. A unified growth model with consistent initial parameters and convergence criteria was adopted for automatic batch fitting of all valid curves. Kinetic parameters including lag phase, maximum specific growth rate and maximum biomass were extracted in batch. Data screening was performed according to the coefficient of determination to remove poorly fitted curves for high-throughput quantitative analysis.


六、常见实操误区

1.每组曲线单独修改拟合初始值,造成组间数据不具备可比性;

2.批量拟合后不核查R²,直接使用全部参数,引入大量低可信度数据;

3.不预先剔除污染、气泡异常孔,导致批量拟合大量报错;

4.论文方法部分不写明批量拟合模型、收敛标准、数据筛选阈值,容易受到审稿人问询。