一、基础图像硬性文件规格
1. 图像储存格式
oCelloScope导出的真菌萌发显微大图优先选用无损TI‑FF格式,该格式适配绝大多数微生物方向高分期刊;组合时序拼接图导出PDF矢量文件,文字标注、标尺、分组标签使用矢量图层,禁止采用jpg有损压缩存储原图,压缩产生的噪点会干扰孢子、纤细芽管细节展示,原始未裁剪成像文件需要当做补充材料上传至投稿系统。
2. 分辨率与色彩模式
彩色萌发成像图片分辨率最低设置300 dpi,灰度显微图像调整至600 dpi;线上刊发选用RGB色彩模式,印刷类期刊依照投稿指南切换CMYK模式,所有成像原图不可以大幅度调整对比度、锐化,仅可进行全图统一亮度校正,不能单独修改局部孢子和芽管区域参数。
3. 画布尺寸标准
单栏配图整体宽度控制8‑9 cm,适合放置单组时间梯度萌发照片;双栏宽幅大图宽度设置16‑17 cm,用于多组别对照、长时间时序排布大图,图片高度不能超出期刊规定的24 cm上限,整张画布长宽比例维持7比5,画面布局规整舒服。
二、萌发大图画面内容以及布局格式
1. 时序排布规范
时序对比图依照培养时间由左至右依次摆放,从孢子0 h休眠状态、吸水膨胀、芽管伸出、初生菌丝延展依次排序;多实验组对照采用纵向排布,空白对照组、溶剂对照组、梯度药物处理组从上往下分行摆放,每一张子成像图的对焦深度、Z‑stack扫描层级保持统一。
2. 标尺标注规范
每一张独立显微成像截图必须添加标尺标识,孢子萌发早期标尺设置20 μm‑50 μm;菌丝发育后期标尺调整至100–200 μm;标尺线条粗细统一设置0.75 pt,标尺配套的数字字体全篇图片保持一致。
3. 分组标签规范
分组标识、时间标记统一选用Arial字体,字号8 pt,颜色为黑色;标签放置于图片边角空白位置,不能够遮挡孢子、芽管、菌丝主体结构;多张子图采用a、b、c、d进行子图标号,标号放置在子图左上角。
4. 成像深度说明
如果图片来源于Z‑stack分层扫描,需要在标签或者图注标注成像所在深度,微孔底板成像、中层悬浮菌丝成像分开标注清楚;对比菌丝球、成团菌丝的大图,需要展示同一深度层级的成像结果,规避深度不一致带来的视觉偏差。
三、图像后期处理约束标准
1. 只能够执行全画布统一的亮度、对比度校正,禁止裁剪之后只挑选萌发状态理想的局部视野,如需局部截图,投稿的时候上传完整原始视野图像作为附件材料。
2. 不可以涂抹、去除杂质、人为修饰孢子以及芽管形态;培养基颗粒、灰尘杂质正常保留,能够证明成像检测环境真实。
3. 时序大图所有子图的曝光参数、倾斜照明角度、Z轴层间距参数需要在实验方法部分写明。
四、图注(figure legend)高分期刊格式
1. 开头一句话点明图片核心结论,例如该时序图像展示不同抑制剂条件下曲霉孢子萌发以及芽管生长动态。
2. 依次交代菌株种类、培养基类型、培养温度、oCelloScope成像模式、Z‑stack扫描参数、标尺数值。
3. 解释每一行、每一列子图对应的处理组别、各个时间点含义。
4. 补充说明配套动力学参数,萌发迟滞时长、萌发率、菌丝覆盖率的数据来源。
5. 方法层面注明整套成像重复生物学次数。
五、补充材料与原图归档规范
1. 正式正文使用经过排版的组合大图;全部原始单张延时扫描图像、分层Z‑stack堆栈文件、视频文件,作为补充材料提交。
2. 图片文件命名简单清晰,例如Figure1‑spore‑germination‑time‑gradient,方便审稿人查阅。
