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抗真菌药物高通量筛选,国际通用oCelloScope方法

来源: 发布时间:2026-07-27 11:00:47 浏览:31 次

一 实验目的

1 遵循CLSI M27、ISO 16256国际抗真菌药敏试验通用标准,依托丹麦BioSense oCelloScope系统建立标准化、可全球通用的抗真菌药物高通量筛选方法,替代传统微量肉汤稀释终点判读法,实现动力学全程定量检测。

2 利用设备FluidScope液体多层堆栈成像技术,高通量同步完成化合物库、单体提取物、复方制剂对酵母菌、丝状真菌的抑菌活性初筛,自动判定最低抑菌浓度MIC、萌发延滞期、菌丝形态损伤等多重药效指标。

3 解决传统OD浊度法灵敏度不足、无法区分抑菌与畸形假生长、只能终点读数的缺陷,通过时序成像直观呈现药物对孢子萌发、芽管延伸、菌丝分枝、菌丝球形成的抑制表型,形成可被国际期刊与药敏实验室认可的规范操作体系。

4 搭建96孔板单批次多菌株、多药物浓度梯度、多重复并行筛选体系,实现长时间无人值守自动化监测,提升新药筛选通量与数据重复性。


二 实验前期材料、仪器与前期准备

1 受试菌株与标准化菌悬液制备(符合国际药敏接种量规范)

酵母菌(白色念珠菌、光滑念珠菌等)采用YPD固体培养基30℃培养48h,挑取单菌落用无菌生理盐水调至0.5麦氏浊度,再梯度稀释至终浓度1×10³ CFU/mL。

丝状真菌(曲霉、镰刀菌、青霉等)PDA平板25~28℃培养7d产孢,0.05%吐温80无菌生理盐水洗脱孢子,四层纱布过滤去除菌丝碎片,血球计数板计数后稀释为1×10³~1×10⁴ CFU/mL,该接种密度为oCelloScope国际通用推荐浓度,可保证单细胞/单孢子独立追踪成像。

菌悬液置于冰浴环境,30分钟内完成加板,避免提前启动萌发导致延滞期数据失真。


2 培养基、药物梯度与对照组设置(国际通用肉汤体系)

酵母菌使用RPMI 1640液体培养基,丝状真菌使用RPMI 1640或PDB液体培养基,调节pH至7.0,121℃高压灭菌20min,冷却备用,全程纯液体培养,不添加琼脂。

受试药物采用二倍倍比梯度稀释,溶剂为DMSO或无菌水,母液经0.22μm滤器除菌,孔内终溶剂浓度不超过1%,排除溶剂本身抑菌干扰。

按照国际药敏试验要求设置全套对照组:无菌培养基空白对照组、溶剂对照组、真菌正常生长阳性对照组、已知阳性抗真菌药物质控对照组(氟康唑、卡泊芬净、伏立康唑等)。

单孔终体积统一设定100μL,适配设备96孔扫描参数。


3 oCelloScope仪器硬件与UniExplorer软件国际标准参数预设

主机放入恒温培养箱提前预热2h,执行光路灰度校准、空白培养基基线校正,消除培养基杂质、药物析出颗粒背景干扰。

软件新建高通量药敏筛选任务,丝状真菌选择FluidScope液体深层扫描模式,酵母菌选择常规透射扫描模式,强制开启SESA静态杂质过滤算法,剔除结晶、沉淀假阳性信号。

Z轴扫描步长固定10μm,覆盖微孔底部至液面全部深度;全板扫描时长控制在3分钟以内;时序拍摄间隔设定为30min/次,总监测时长酵母菌24h、丝状真菌72~168h,满足国际标准所需完整生长周期。

软件预设BCA总吸收算法计算菌丝/菌体累积面积,自动拟合生长动力学曲线、计算AUC曲线下面积、萌发延滞时间、最大生长速率,开启形态学参数自动量化模块,用于判断药物诱导菌丝肿胀、扭曲、断裂等损伤表型。

培养温度严格按照菌株国际培养标准设定,酵母菌35℃,霉菌25~28℃,箱体温度波动控制±0.5℃以内。


4 耗材与高通量排布规范

采用无菌平底96孔聚苯乙烯微孔板,最外圈所有孔填充对应液体培养基作为蒸发补偿孔,防止边缘孔液体挥发造成渗透压改变影响药敏结果。

每个药物浓度梯度、每株真菌设置不少于4个生物学复孔,96孔板可一次性排布10组以上药物梯度+多菌株平行筛选,符合高通量药物筛选布局逻辑。


三 实验操作

1 超净台无菌加样与板前预处理

全程在二级生物安全柜内无菌操作,固定加样顺序:液体培养基→梯度药物工作液→标准化真菌菌悬液,避免药物直接接触菌体造成局部浓度冲击。

加样完成后微孔板水平放置,300g低速离心1min,使孢子或酵母细胞均匀沉降至孔底,同时彻底排出孔内微小气泡,防止气泡遮挡扫描光路造成成像缺失。

使用透气疏水封板膜密封整块板,既保证有氧代谢气体交换,又减少长期培养水汽冷凝滴落污染,封板后室温避光静置60min,等待菌体完全沉降稳定后上机。


2 板体装载与高通量筛选任务启动

将密封完成的96孔板平稳卡入设备专用板架,扣紧卡扣防止长时间时序扫描过程板体位移偏移,保证图像堆栈对齐。

在UniExplorer软件内选择对应96孔板型号,录入菌株编号、药物名称、浓度梯度、培养温度、扫描间隔、监测总时长等实验信息,勾选图像堆栈存储、动力学自动分析、MIC自动判定、形态学参数导出全部模块,核对参数与国际通用试验要求一致后,启动全自动无人值守时序扫描。

整个监测周期无需开盖、无需人工干预,仪器按照设定间隔自动完成逐层成像与像素量化分析。


3 实验终止、数据导出与结果判定(国际通用判定逻辑)

预设监测周期结束后,在软件端终止运行任务,取出微孔板进行高压灭菌无害化处理,真菌废弃物按生物危害垃圾规范处置。

第一部分导出定量药敏数据:系统依据生长曲线抑制率自动给出各药物对菌株的MIC值、生长抑制AUC、萌发延滞延长比例、最大生长抑制速率,可直接对标CLSI肉汤稀释法判定标准。

第二部分导出原始成像数据:各时间点原位聚焦图片、Z轴三维堆叠重建图像,用于佐证低浓度药物仅延迟萌发、高浓度直接阻断芽管伸出、亚抑菌浓度导致菌丝畸形等表型,作为药效机制补充证据。

所有工程源文件、数值表格、时序影像本地完整备份,满足论文投稿与方法学溯源要求。


4 方法学验证平行操作(可选,国际文章必备)

选用标准质控菌株重复整套梯度筛选实验,保持培养基、接种量、仪器扫描参数完全一致,验证MIC结果重复性;同时采用CLSI标准微量肉汤稀释法做平行比对,确认oCelloScope成像法与国际参考方法结果相关性,提升方法认可度。


四 国际通用药效判定指标与质控标准

1 核心定量药敏指标

最低抑菌浓度MIC,定义为完全抑制真菌可见生长的最低药物浓度,由软件基于菌丝累积面积曲线自动判定;生长曲线下面积AUC抑制率,量化药物整体抑制强度;孢子萌发延滞期延长时长,评价药物对休眠孢子激活的阻滞作用。

2 形态学辅助判定指标

丝状真菌芽管长度、分枝数量、菌丝球直径、异常菌丝占比;酵母菌出芽抑制率、细胞膨大畸形比例,用于区分杀菌效应与单纯生长抑制效应。

3 数据有效性国际质控规则

空白对照组全程无真菌生长像素信号;阳性对照组菌株生长动力学曲线正常上升;平行复孔MIC结果完全一致,动力学数值相对偏差小于5%;质控药物MIC落在国际标准菌株允许误差区间内,方可判定本次高通量筛选数据有效。


五 实验质控关键点与注意事项

1 接种量严格标准化

菌悬液浓度偏差会直接导致MIC漂移,必须严格按照CLSI规定浊度/孢子数进行稀释,每批次都做计数复核,这是方法国际通用性的核心前提。

2 溶剂与药物析出干扰控制

脂溶性药物易在RPMI培养基中析出微小颗粒,必须设置溶剂空白孔,依靠SESA过滤算法剔除杂质信号,避免系统将结晶误判为真菌生长造成MIC假性偏高。

3 扫描频率不低于30分钟间隔

高频扫描才能捕捉早期萌发延滞期抑制效果,符合oCelloScope国际发表文献通用设置,间隔过大会丢失早期药效动力学数据。

4 蒸发与氧环境管控

必须使用透气封板膜+外圈补偿孔,密闭缺氧环境会造成真菌生长自发抑制,导致药物筛选假阳性结果,违背肉汤微量稀释法国际培养条件要求。

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