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抑菌动力学曲线图,期刊标准化排版规范。

来源: 发布时间:2026-07-24 10:21:13 浏览:21 次

一、抑菌动力学曲线图期刊标准化排版完整方案(基于oCelloScope导出数据)

1. 前期数据导出规范(绘图基础,决定图表合规性)

1.1 仪器端原始数据导出要求

实验结束后从UniExplorer软件导出UTF-8编码CSV格式时序数据,优先选用菌体像素总面积作为纵坐标主指标,等效TA浊度作为辅助佐证数据;同步导出各组时间戳、复孔数值、药物浓度分组信息。

剔除变异系数大于15%的异常复孔,计算每组同一时间点平均值与标准差,保留均值±标准差用于误差棒绘制。

文件命名统一规则:菌株名称_药物名称_浓度_监测时长_像素面积动力学数据.csv,避免后期分组混乱。

1.2 数据预处理整理规则

横坐标统一换算单位为小时(h),不保留分钟原始数值;例如扫描30 min计为0.5 h,保证坐标轴刻度简洁统一。

所有组别时间轴完全对齐,缺失时间点采用空白占位,不做插值填充;阴性空白对照组基线数值整体做基线扣减校正,消除培养基背景信号干扰。

将野生株/耐药株、不同药物浓度、有无药物处理、复配组合等分类单独列标签,方便绘图软件一键分组配色。


2. 绘图软件通用格式设定(GraphPad Prism/Origin/Excel期刊通用标准)

2.1 画布与整体尺寸设置

单张动力学曲线图版面比例统一采用16:9或者8:5,SCI一区期刊优先使用8.5 cm(宽度)×6 cm(高度)单栏图;双栏大图宽度设置17 cm,高度7–8 cm。

画布底色全部设置纯白色,无任何阴影、渐变、边框装饰;绘图区域外无多余留白,仅保留坐标轴、图例、坐标轴标签。

2.2 坐标轴排版硬性规范

横坐标标签:Time (h),字体选用Arial,字号9–10号;刻度向内朝向绘图区,刻度线粗细0.75 pt。

纵坐标标签:Normalized total bacterial pixel area(归一化菌体像素总面积),如果使用浊度则标注TA absorbance;标签竖排文字,字号9–10号,单位括号标注清晰。

坐标轴外框仅保留左轴、下轴两条实线,上边框和右边框全部隐藏;线条粗细统一0.75 pt。

坐标轴刻度间隔均匀,最大刻度值略高于阳性对照组最高生长峰值,不出现曲线顶到画布边缘的情况;原点强制设为0,不截断纵坐标基线,保证生长抑制趋势客观展示。

误差棒仅保留纵向Y轴误差,横向误差不显示;误差棒线条粗细0.5 pt,端点不加小横线,避免画面杂乱。


3. 曲线、线条与配色期刊规范

3.1 线条样式规则

每组动力学曲线使用连续实线,不使用虚线、点划线;线条粗细统一1.0 pt,保证印刷后清晰可辨。

阳性无药生长对照曲线统一作为基准参考线;完全抑制组别曲线贴近基线平稳运行;菌体裂解组允许后期曲线向下回落,如实体现oCelloScope观测到的消亡趋势。

同一药物不同浓度采用同色系深浅渐变区分,不同处理组别使用色相差异明显的颜色,最多不超过6种主颜色,防止图例过于冗长。

3.2 配色禁用与推荐方案

禁止使用荧光色、高饱和度刺眼颜色、浅黄浅灰浅色曲线(印刷灰度图无法区分)。

期刊安全配色组合:深蓝色、酒红色、墨绿色、深橙色、深紫色、炭灰色;黑白印刷模式下同时搭配线型区分(仅期刊要求黑白图时启用)。

单张图内曲线数量控制在8条以内,过多分组拆分多张子图,不拥挤堆叠。


4. 图例、标注与子图规范

4.1 图例排版要求

图例放置在绘图区域内部右上角空白处,若内部无空间则放置在图下方居中排布;图例边框设置为无框,底色透明。

图例文字内容精简,格式统一:Concentration + 单位,例如1/2 MIC、64 μg/mL、Positive control、Blank control;字体Arial,8号字。

不使用图标符号、方块圆点标记叠加在曲线上面,仅保留纯线条,保证曲线流畅直观。

4.2 子图组合规范(多变量对比常用)

如需同时展示野生株与耐药株、浮游菌与生物膜、不同温度条件,采用A/B/C子图拼接,左上角标注小写字母a、b、c,字体加粗Arial 10号。

子图之间间距保持0.5 cm,共用横坐标或者纵坐标,避免重复标注;整体统一坐标轴刻度范围,保证组间视觉可对比。


5. 附加标注、统计学与图像联动规范

5.1 显著性标记排版

仅在需要差异说明的时间点上方标注*、**、***,标记字号8号,垂直向上对齐,不遮挡曲线主体;不在整条曲线上大量打点标注,保持图表整洁。

统计学注释统一放在图注中说明:*P<0.05,**P<0.01,ns无显著性差异。

5.2 结合oCelloScope成像的组合图规范

顶刊常用动力学曲线+原位显微图像拼接组图:上方为动力学折线图,下方对应关键时间点Z轴成像小图,小图添加比例尺,比例尺统一放置在图片右下角,标注Scale bar = 5 μm。

成像小图不加多余边框,灰度模式导出,与曲线图风格统一。


6. 图片导出格式与分辨率(期刊硬性要求)

导出文件格式三选一:TIFF、EPS、PDF,禁止直接提交JPG图片。

分辨率设置:彩色图300 dpi,灰度/黑白图600 dpi;压缩模式选择LZW无损压缩,避免图片模糊。

文件命名按照期刊投稿要求:Figure 1_Suppressive kinetic curve.tif,不使用中文、特殊符号。


7. 图注(Figure legend)标准化书写模板

Figure X Growth kinetic curves of strains treated with different concentrations of antibacterial agents monitored by oCelloScope system. The vertical axis represents normalized total bacterial pixel area calculated from Z-stack sequential scanning images, and the horizontal axis represents incubation time in hours. Data are presented as mean ± standard deviation of at least four biological replicates. Positive control represents bacteria cultured without drugs, blank control represents sterile medium only. The curves reflect the lag phase, growth rate and lysis phenotype of bacteria under drug stress.


二、完整排版避坑质控要点

1 不直接使用原始未扣基线的浊度曲线,必须扣除空白培养基背景,符合药效学量化规范。

2 不随意截断Y轴零点,否则会夸大抑制效果,审稿人极易提出返修。

3 复孔标准差过大的数据点直接剔除,误差棒不能大面积交叉重叠导致无法区分组别。

4 多张对比图坐标轴刻度范围完全统一,保证视觉上可以直观判断抑制强弱。

5 曲线如实体现oCelloScope观测到的菌体裂解下降段,不要人为修平数据,体现仪器动态监测优势。

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